메타게놈 분석 (Metagenomic Analysis) 1. 개요 메타게놈 분석(Metagenomic Analysis)이란 특정 환경 시료(토양, 해수, 인체 분변 등)에 존재하는 모든 미생물의 유전체(Genome)를 배양 과정 없이 직접 추출하여 분석하는 총체적 유전체 분석법이다. 전통적인 미생물학은 특정 균주를 실험실 내에서 순수 배양(Pure Cult…
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변이 탐지 (Variant Calling) 1. 개요 변이 탐지(Variant Calling)란 차세대 염기서열 분석(NGS, Next-Generation Sequencing)을 통해 얻은 샘플의 염기서열 데이터를 표준 참조 유전체(Reference Genome)와 비교하여, 염기서열의 차이가 발생하는 지점을 식별하고 그 유형을 결정하는 생물정보학적 분석 …
IGV (Integrative Genomics Viewer) 1. 개요 IGV(Integrative Genomics Viewer)는 고해상도 유전체 데이터를 시각적으로 탐색하고 분석하기 위해 개발된 오픈 소스 인터랙티브 유전체 브라우저(Genome Browser)이다. 차세대 염기서열(NGS, Next Generation Sequencing) 기술로 생성되…
Galaxy (생물정보학 플랫폼) 1. 개요 Galaxy는 생물학 및 생물정보학 분석을 위해 설계된 오픈 소스 기반의 웹 기반 데이터 분석 플랫폼이다. 이 플랫폼의 주된 개발 목적은 복잡한 명령줄 인터페이스(CLI, Command Line Interface) 사용법을 익히지 않은 생물학자나 의료 전문가들이 전문적인 생물정보학 도구를 쉽게 사용할 수 있도록 …
엔드 리페어 (End Repair) 1. 개요 엔드 리페어(End Repair)는 차세대 염기서열 분석(Next-Generation Sequencing, NGS)의 라이브러리 제작(Library Preparation) 과정에서 수행되는 필수적인 전처리 단계이다. DNA 추출 또는 단편화(Fragmentation) 과정을 거친 DNA 조각들은 끝부분이 불규칙…
라이브러리 구축 개요 라이브러리 구축(Library)은 분자생물학,전학, 유전체학 등 다양한 생물학 분야에서 핵심적인 실험 기법 중로, 특정 생체의 유전물질(예: DNA, RNA)을 조각화하고 이를 벡터에 삽입하여 대량의 유전자 조각 집합체를 만드는 과정을 의미합니다. 이 과정을 통해 연구자들은 유전체 전체 또는 특정 유전자 집단을 체계적으로 분석할 수 있…
차세대 염기서열석 개요 차대 염기서열 분석Next-Generation Sequencing, NGS) 21세기 초반부터 급히 발전한 고속 유전체 분석 기술로, 기존의 Sanger기서열 분법에 비해씬 빠르고 저렴하게 대량의 DNA 또는 RNA 서열을 해독할 수 있는 방법입니다. NGS는 생명과학, 의학, 농업, 환경생물학 등 다양한 분야에서 핵심적인 도구로 자…
유전자 데이터 분석 개요 유전자 데이터 분석(Gene Expression Data Analysis)은 생물정보학(Bioinformatics)의 핵심 분야 중 하나로, 생물의 유전 정보를 해석하고 생명 현상의 기초를 이해하는 데 중요한 역할을 한다. 최근 고차원 유전체 기술(예: 차세대 염기서열 분석, DNA 마이크로어레이, RNA-Seq 등)의 발전으로 인…
생물정보학 개요 생물정보(Bioinformatics) 생물학, 컴퓨터 과학, 수학, 통계학, 정보공학을 융합하여 생물학적 데이터를 수집, 저장, 분석, 해석하는 학제간 학문 분야이다. 특히 유전체학(genomics), 단백질체학(proteomics), 전사체학(transcriptomics) 등에서 발생하는 대량의 생물학적 데이터를 다루는 데 핵심적인 역할을…