KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)는 유전자와 게놈의 관계를 분석하여 생물학적 시스템의 기능을 이해하기 위해 구축된 통합 데이터베이스입니다. 분자 수준에서 일어나는 화학 반응과 상호작용을 네트워크 형태로 모델링하여, 유전체 정보…
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Gene Ontology (GO) Gene Ontology (GO)는 유전자와 단백질의 기능을 설명하기 위해 생물종에 관계없이 공통적으로 사용할 수 있도록 표준화된 어휘 체계(Controlled Vocabulary)이자 유향 비순환 그래프(DAG) 기반의 지식 베이스이다. 1. 개요 현대 생물학에서는 유전체 분석 기술의 발달로 수많은 유전자가 발견되었으나,…
순서형 범주 개요 순서형 범주(Ordinal Category)는 범주형 데이터의 한류로, 특정한 순서나 등급이 존재하는 범주를 의미합니다. 데이터 과학과 통계 분석에서 데이터는 일반적으로 정량형(수치형)과 정성형(범주형)으로 나뉘며, 정성형 데이터는 다시 명목형 범주(Nominal Category)와 순서형 범주(Ordinal Category)로 구분됩니다…
Neurospora crassa (붉은빵곰팡이) 1. 개요 Neurospora crassa는 자낭균문(Ascomycota)에 속하는 사상균(Filamentous fungi)으로, 주로 탄화된 식물체나 불에 탄 지역의 토양에서 발견되는 곰팡이의 일종이다. 명칭은 '붉은빵곰팡이'로 알려져 있으나, 실제 주 서식지는 빵보다는 탄화된 식물체라는 점에 유의해야 한다…
기능 유전체학 (Functional Genomics) 1. 개요 기능 유전체학(Functional Genomics)은 유전체(Genome)의 전체적인 서열 정보를 바탕으로, 유전자와 그 산물(RNA, 단백질 등)이 생물체 내에서 실제로 어떻게 작동하며 상호작용하는지를 연구하는 학문이다. 전통적인 구조 유전체학(Structural Genomics)이 DNA …
OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man) OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)은 인간의 모든 알려진 멘델 유전 질환과 그와 관련된 표현형(Phenotype, 유전자 변이로 인해 겉으로 드러나는 신체적·생리적 특성) 사이의 관계를 체계적으로 정리한 종합 유전 정보 데이터베이스이다. 1.…
Galaxy (생물정보학 플랫폼) 1. 개요 Galaxy는 생물학 및 생물정보학 분석을 위해 설계된 오픈 소스 기반의 웹 기반 데이터 분석 플랫폼이다. 이 플랫폼의 주된 개발 목적은 복잡한 명령줄 인터페이스(CLI, Command Line Interface) 사용법을 익히지 않은 생물학자나 의료 전문가들이 전문적인 생물정보학 도구를 쉽게 사용할 수 있도록 …